暗号解読専門女子校に入れられた適当な男子が大奮闘！

暗号を解読することを専門とする学校の各クラスに一人ずつ入れられた「どうでもいい男子生徒」の一人・いろはは、他クラスの凍を匿ったことで、学園の女王に目をつけられてしまう。凍から託された暗号解読メガネを使いどうにか難問を超えていくが、背後には大きな陰謀が!?